AI改變基礎科學研究范式
——國內(nèi)學者解讀二○二四年諾貝爾化學獎
10月9日,2024年諾貝爾化學獎揭曉。戴維·貝克、德米斯·哈薩比斯和約翰·江珀共享這一獎項。前者在“計算蛋白質設計”領域貢獻突出,后兩位則在“蛋白質結構預測”方面成就斐然。這也是繼物理學獎之后,今年諾貝爾獎再次被授予人工智能(AI)的相關成果及科學家。
獲獎結果眾望所歸
作為全球最重磅的科技獎項之一,每年諾貝爾獎頒獎前,各類預測層出不窮。在今年諾貝爾化學獎揭曉前,此次獲獎的三位科學家已呼聲極高,獎項結果稱得上眾望所歸。
“尤其是貝克,他是蛋白質計算設計領域的拓荒者,并且持續(xù)做出國際先進的研究成果。我認為他們獲獎實至名歸!鼻迦A大學生物醫(yī)學交叉研究院助理教授、北京生命科學研究所研究員徐純福認為,在今年物理學獎已經(jīng)頒發(fā)給機器學習科學家的情況下,諾貝爾化學獎仍然頒發(fā)給了三位計算研究領域的科學家,這體現(xiàn)了AI極其重要的科學價值。
“獲獎成果和我的研究領域息息相關,對我們研究者是一種激勵!闭憬髮W生命科學研究院研究員林世賢激動地說,獲獎者之一的江珀只有39歲,這對廣大青年科研工作者也是一種鼓舞。
蛋白質結構預測一直是計算生物學和結構生物學所關心的重要問題。清華大學生命科學學院教授楊茂君介紹,早期蛋白質結構預測主要依靠同源蛋白結構,但是實驗解析的蛋白結構數(shù)量占總蛋白數(shù)量的比例很低,因此預測效率不高、準確度有限。后期,隨著機器學習興起,人工智能迅速發(fā)展,科學家開始嘗試將人工智能應用于蛋白質結構預測領域,開發(fā)出結構預測工具“阿爾法折疊”以及后續(xù)版本。該成果實現(xiàn)了蛋白質結構預測精度和效率的飛躍,幾乎解決了單一蛋白質結構預測的問題,有望給藥物研發(fā)帶來重要變革。
AI用于科研潛力巨大
此次諾貝爾化學獎,除了是對獲獎者的表彰,也是對人工智能在基礎科學研究領域深入應用的重要認可。
楊茂君認為,這次獲獎的研究定義了一個理論上可以解決所有科學問題的范式,即從實際問題出發(fā),將其轉變?yōu)锳I可以處理的輸入數(shù)據(jù),再經(jīng)過深度學習網(wǎng)絡,最終輸出結果。
“在所有通過輸入得出輸出的問題上,AI理論上都可以作為有力的工具,這反映了AI在科學研究領域的廣闊潛力!痹跅蠲磥恚@一技術的應用范圍并不限于生物、化學、物理等領域,其應用范圍主要取決于如何將客觀世界的問題(或數(shù)據(jù))抽象成AI可以學習和處理的形式,以及現(xiàn)實世界是否有足夠多的真實數(shù)據(jù),訓練和構建深度學習網(wǎng)絡。
“AI在蛋白質設計領域的應用突破可以說是天時地利人和,水到渠成。”楊茂君解釋,蛋白結構的一級序列足夠簡單,且蛋白質的三維結構輸出也有標準的表達形式,并且在過去幾十年,結構生物學領域累積了大量真實蛋白結構數(shù)據(jù)。
徐純福也表示,AI在生物、化學、醫(yī)藥等健康領域的潛力才剛剛嶄露一角,未來還大有發(fā)展空間。
“就拿我最熟悉的蛋白質計算設計來講,雖然今年相關成果獲獎了,但計算方法在功能蛋白的設計方面還面臨很大挑戰(zhàn)。”徐純福說,如果進一步改進AI算法,能夠更準確設計酶、抗體等重要的功能蛋白,將有可能產(chǎn)生具有真正實用的全新蛋白。
徐純福同時認為,AI對科學研究重要性日益凸顯,科學家一方面要積極擁抱新的研究范式,同時也要盡量規(guī)避AI的局限性!癆I不是萬能的,科學家們需要揚長避短,推動AI在基礎科研更有效應用!彼f,科學家要更負責任地應用AI,不用AI做違背科學倫理、有害人類健康的科學研究。
(記者都芃、記者張佳星對本文亦有貢獻)
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